Πολιούχος της ενορίας Πολυρρήνιας Κισάμου, ο ναός των Αγίων Ενενήκοντα Εννέα Θεοφόρων Πατέρων των εν Κρήτη Λαμψάντων κτίστηκε το 1894 σε βασιλικό ρυθμό δίπλα από τα ερείπια του αρχαίου ιερού της θεάς Άρτεμης, στον αρχαιολογικό χώρο της Πολυρρήνιας. Για την κατασκευή του ναού χρησιμοποιήθηκαν αρχιτεκτονικά μέλη του αρχαίου ιερού και γι’ αυτό αρκετές εντοιχισμένες πέτρες (γωνιόλιθοι) έχουν επάνω τους χαραγμένες τιμητικές επιγραφές, καθώς και ονόματα πολιτών που επισκέφτηκαν το ιερό και έγραφαν το όνομά τους πάνω σ’ αυτές. Πράγματι, το 1938 η αρχαιολογική σκαπάνη έφερε στο φως ένα  κτίριο καλής κατασκευής των πρώιμων ελληνιστικών χρόνων και μια στοά ή ένα μνημειώδη βωμό, που πιθανόν άνηκε σε ναό. Ο ναός είναι κοιμητηριακός και εγκαινιάστηκε από τον μακαριστό Επίσκοπο Κισάμου και Σελίνου Ευδόκιμο. Θησαύρισμα του ιερού ναού είναι τεμάχια από τα ιερά λείψανα των Αγίων Πατέρων, τα οποία είχε αφιερώσει στο ναό ο ιερομόναχος Γαβριήλ, παλαιός εφημέριος της ενορίας.